Nome: Evangelion Unidade 00
Tipo: Protótipo
Piloto: Rei Ayanami
Em japonês: Zerogoki
Armas utilizadas: Faca Progressiva; Rifle; Positron; Bomba N2; Lança de Longinus
Feito apartir de: Adão

Com a danificação do Evangelion Unidade 00 laranja, após a luta contra Ramiel, o 5º Angel, o Eva foi reconstruído passando a ser azul e possuir a parte que fica nos ombros dos Evas onde é guardado a Faca Progressiva. O Eva continua a ter problemas, entrando em beserker, porém passou a participar mais das lutas. A partir do nono angel, o Eva 00 ( agora azul ) passou a ter constante aparição nas lutas. Lutou contra Matarael, Sahaquiel, Leliel, Bardiel, Zeruel, Arael e Armisael. Foi feito a partir de Adão.